微生物制剂是将自然界有益细菌通过人工筛选培育，再经过生物工程生产出来，用于生态调控及动物营养保健的活菌制剂。现在市场上销售的这类产品名目繁多，如EM菌、光合细菌、芽孢杆菌、硝化细菌、乳酸菌、酵母菌等，都属微生物制剂的同类产品。就有益菌种来讲，美国发布了40种安全有效的有益菌种，、嗜乳酸杆菌、乳链球菌、枯草芽孢杆菌、纳豆芽孢杆菌、啤酒酵母菌、沼泽红假单胞菌等12种。依活菌种的组成，有单一菌制剂和复合菌制剂。

微生物制剂作用与特点

(一)对水体的作用

微生物制剂可有效降低养殖水质中亚硝酸盐、氨氮、硫化氢等浓度，抑制水体中有害微生物繁殖和生长，净化水质。

（二）对养殖动物的作用

微生物制剂可使养殖动物提高机体免疫力。防止水产养殖动物体内有害物质产生。同时，转化养殖动物肠道、血液及粪便中有害物质浓度，降低有害物质在机体内的累积，有利于机体的健康。

（三）降低成本，保护环境

微生物制剂具有投资小、效益高、使用方便等优点。既能全池泼洒，也能做为饲料添加剂。无毒、无害、无药物残留，长期使用可以减少养殖过程中抗生素的使用量，减少病害发生，排放的污水对环境污染也较小。

微生态制剂用于调控水质的使用原则

自然水体存在一定的细菌生态平衡系统，施用微生态制剂是人为改变条件，定向培育优势菌群并发挥其作用，形成新的动态平衡。在微生态制剂的使用过程中，首先要根据水体的理化因子正确选用菌种;其次，施放微生态制剂要达到一定的浓度、确保水体中活菌数达到一定数量，并营造适合培育菌种的生长条件，使之尽早形成并维持优势菌群，以取得良好的使用效果。